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三代转录组测序
由于二代测序平台的转录组读长的相对较短,数据组装的过程中存在较多的嵌合体,不能准确的得到完整转录本的信息。因此对后续的表达量分析、可变剪接、基因融合等分析造成了较大的影响。而PacBio的单分子实时测序技术,平均读长达到10K以上,最长可达40Kb,这样的长度已经超过了转录组中典型的基因的长度,所以基于第三代测序平台的转录组的研究,可以直接得到全长转录本信息,而无需组装,从而最大限度的保证了转录组测序结果的准确性。
产品优势
策略多样:除常规的全长转录组文库外,还可根据需求增建5-10K大片段文库,满足客户对长转录本的研究需求。
样品起始量低:全长转录组样本需求仅1ug,远低于同行样本量需求。
信息分析内容全面:实时跟进科学研究前沿,不断升级信息分析内容。
个性化分析:具有丰富个性化分析经验,可根据项目需要选择最适宜的分析软件,只为保障最精准结果。
无需组装:长读长不需要组装,就可以准确的得到全长转录本的序列信息。
精准基因集:借助三代读长的优势获得更精准基因集,可以改善基因表达定量的结果。
更多新发现:可以发现新的基因和转录异构体,并准确的鉴定可变剪接及基因融合现象。
辅助基因注释:可辅助基因组de novo基因注释,获得更好的基因注释结果。
经验丰富:已完成100+个全长转录组数据分析,信息分析人员问题处理经验丰富。
研究内容
一、无参考序列物种
标准信息分析:
1. 数据质控、转录本分类
2. 转录本聚类与校正
3. 七大转录本数据库注释
4. 作为参考序列、定量分析
5. lncRNA预测
6. 编码蛋白框预测
定制化信息分析:
可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容。
二、有参考序列物种
标准信息分析:
1. 数据质控、转录本分类
2. 转录本聚类与校正
3. 与参考基因组比对
4.进行可变剪切分析
5.新基因预测
6.融合基因分析
7.作为参考序列,定量分析
8.编码蛋白框预测
9.lncRNA预测
定制化信息分析 :
可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容
由于二代测序平台的转录组读长的相对较短,数据组装的过程中存在较多的嵌合体,不能准确的得到完整转录本的信息。因此对后续的表达量分析、可变剪接、基因融合等分析造成了较大的影响。而PacBio的单分子实时测序技术,平均读长达到10K以上,最长可达40Kb,这样的长度已经超过了转录组中典型的基因的长度,所以基于第三代测序平台的转录组的研究,可以直接得到全长转录本信息,而无需组装,从而最大限度的保证了转录组测序结果的准确性。
产品优势
策略多样:除常规的全长转录组文库外,还可根据需求增建5-10K大片段文库,满足客户对长转录本的研究需求。
样品起始量低:全长转录组样本需求仅1ug,远低于同行样本量需求。
信息分析内容全面:实时跟进科学研究前沿,不断升级信息分析内容。
个性化分析:具有丰富个性化分析经验,可根据项目需要选择最适宜的分析软件,只为保障最精准结果。
无需组装:长读长不需要组装,就可以准确的得到全长转录本的序列信息。
精准基因集:借助三代读长的优势获得更精准基因集,可以改善基因表达定量的结果。
更多新发现:可以发现新的基因和转录异构体,并准确的鉴定可变剪接及基因融合现象。
辅助基因注释:可辅助基因组de novo基因注释,获得更好的基因注释结果。
经验丰富:已完成100+个全长转录组数据分析,信息分析人员问题处理经验丰富。
研究内容
一、无参考序列物种
标准信息分析:
1. 数据质控、转录本分类
2. 转录本聚类与校正
3. 七大转录本数据库注释
4. 作为参考序列、定量分析
5. lncRNA预测
6. 编码蛋白框预测
定制化信息分析:
可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容。
二、有参考序列物种
标准信息分析:
1. 数据质控、转录本分类
2. 转录本聚类与校正
3. 与参考基因组比对
4.进行可变剪切分析
5.新基因预测
6.融合基因分析
7.作为参考序列,定量分析
8.编码蛋白框预测
9.lncRNA预测
定制化信息分析 :
可结合客户的需求,协商确定定制化信息分析内容